Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCR4P51679 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCR4P51679 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCR4P51679 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCR4P51679 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCR4P51679 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCR4P51679 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCR4P51679 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCR4P51679 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCR4P51679 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCR4P51679 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCR4P51679 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCR4P51679 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCR4P51679 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms