Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBP2P50120 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBP2P50120 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms