Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP4P49662 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP4P49662 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP4P49662 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP4P49662 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP4P49662 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms