Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD2P49005 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD2P49005 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD2P49005 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD2P49005 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD2P49005 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD2P49005 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD2P49005 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD2P49005 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD2P49005 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD2P49005 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD2P49005 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD2P49005 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD2P49005 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD2P49005 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD2P49005 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD2P49005 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD2P49005 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD2P49005 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms