Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms