Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NSG1P42857 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSG1P42857 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSG1P42857 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSG1P42857 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSG1P42857 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSG1P42857 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms