Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJC1P36383 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GJC1P36383 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms