Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP6P35125 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP6P35125 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP6P35125 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP6P35125 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP6P35125 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP6P35125 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP6P35125 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP6P35125 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP6P35125 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP6P35125 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP6P35125 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP6P35125 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP6P35125 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP6P35125 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP6P35125 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP6P35125 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP6P35125 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
USP6P35125 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP6P35125 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP6P35125 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP6P35125 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP6P35125 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms