Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPOP30536 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPOP30536 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPOP30536 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPOP30536 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPOP30536 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPOP30536 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms