Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms