Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMBRP28336 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMBRP28336 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMBRP28336 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMBRP28336 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMBRP28336 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NMBRP28336 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMBRP28336 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMBRP28336 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMBRP28336 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMBRP28336 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMBRP28336 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NMBRP28336 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NMBRP28336 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NMBRP28336 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NMBRP28336 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms