Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms