Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A1P20849 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms