Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms