Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD53P19397 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD53P19397 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD53P19397 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD53P19397 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD53P19397 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD53P19397 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD53P19397 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD53P19397 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD53P19397 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD53P19397 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD53P19397 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD53P19397 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms