Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIG1P18858 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIG1P18858 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIG1P18858 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIG1P18858 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIG1P18858 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIG1P18858 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIG1P18858 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LIG1P18858 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIG1P18858 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIG1P18858 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LIG1P18858 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIG1P18858 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIG1P18858 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIG1P18858 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIG1P18858 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIG1P18858 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LIG1P18858 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LIG1P18858 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LIG1P18858 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LIG1P18858 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms