Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XBP1P17861 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XBP1P17861 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XBP1P17861 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms