Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2F2P13984 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms