Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA4P13612 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms