Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CT47B1P0C2W7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms