Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4BP0C0L5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BP0C0L5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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