Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB7P09629 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms