Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPBP07199 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPBP07199 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPBP07199 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms