Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms