Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms