Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX58O95786 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX58O95786 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms