Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms