Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX4O95219 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX4O95219 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX4O95219 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX4O95219 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms