Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP2O75323 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms