Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA3O75145 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms