Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG13O75143 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG13O75143 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG13O75143 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG13O75143 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG13O75143 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG13O75143 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG13O75143 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG13O75143 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG13O75143 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG13O75143 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG13O75143 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG13O75143 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG13O75143 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms