Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms