Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms