Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms