Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F3O00716 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F3O00716 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms