Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP17L12C9JPN9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms