Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms