Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms