Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms