Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms