Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TIMM9Q9Y5J7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms