Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms