Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMED7Q9Y3B3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms