Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms