Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THSD7AQ9UPZ6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms