Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms