Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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