Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX6Q9UNH7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX6Q9UNH7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms