Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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