Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms